Игорь, добрый день!
Волновод советский, латунный, посеребренный внутри и окрашенный черной краской снаружи, паяется легко оловянно-свинцовым припоем ПОС-61 или другим, аналогичным. Что касается фланцев, то родной имеет советские крепежные размеры, а тот, что надо припаять можно сделать любым. Можно обрезать или отпаять и имеющийся фланец, заменив его на нужный. Чтобы гарантировать согласование с трактом на WR90 надо сразу сделать в новых фланцах четвертьволновые трансформаторы или применить другие способы согласования, например, путем введения искуственных неоднородностей.