Игорь,- это правильная методика, когда каждая составная часть тракта может быть настроена и проверена отдельно.
Так, собственно, и делается в промышленном производстве и особенно высоки требования там, где передаются большие мощности и, при плохом согласовании, есть риск пробоя или прогорания волноводов.
В нашем случае, при малых мощностях, такого риска нет и, конечно же, можно сразу сделать тракт целиком и пренебречь согласованием или, при большом желании, подкорректировать его, как я писал выше, искуственными неоднородностями индуктивного или емкостного характера.
Принцип прост,- искуственная неоднородность в волноводе в идеале должна "создать" отраженный сигнал, равный по амплитуде и противоположный по фазе сигналу, отраженному от реальной нагрузки (антенны и т.п). В вашем случае - это рупорная антенна, являющаяся облучателем.
Короткий рупор плохо согласовывается со свободным пространством, еще хуже ситуация, когда этот рупор облучает осесимметричную параболу. В этом случае часть энергии от центральной части зеркала отражается и попадает обратно в рупор, ухудшая согласование. Вот тут, для улучшения согласования, и помогут икуственные неоднородности.