" Или как то нужно плату над радиатором поднимать чтобы полоски на одном уровне с выводами транзистора были."
Обычно подкладывают под тонкую плату медную пластину толщиной 0,3-0,8 мм, радиатор вообще не фрезеруют. Если очень хочется, то кладут латунную пластину и её фрезеруют. Транзисторы сделаны почти всегда с учетом такой прокладки, если в ней прорезать окно. Фрезеровка идет только с целью экономии денег, но медную вкладку все равно делают, кладут её под транзистор, загибают на плату и припаивают или подкладывают на внутренней стороне. Дело в том, что алюминий сразу после обработки покрывается слоем окисла (корунд) и этот окисел имеет большое сопротивление, что может привести к перегреву транзистора и к потере мощности из-за переходного сопротивления транзистор - земля. Поэтому многие не очень СВЧ транзисторы не очень малой мощности имеют с двух сторон от выводов ещё и земляные выводы. Пример тому: особенности сварки алюминия - у сварщиков всё это объяснено. Что касается FR4 и нашего СТФ, то по паспорту на частоте 1 МГц тангенс угла потерь для плат толщиной 0,8-3 мм составляет соответственно 0,017 и 0,03, т.е. СТФ в 2 раза хуже.
73!