Можно и параллельно, но нужен ответвитель или диплексер. У меня такого добра под руками не нашлось, поэтому остановился на варианте слушать по очереди, в любой момент могу снять питание с реле и послушать на трансивер.
QTHID от OZ9AEC использовал первое время, пока не появилась прямая поддержка FunCube в LinRad, для управления частотой и параметрами. В принципе то же что и авторский вариант FCHID, только чуть лучше оболочка, лучше юзабилити и возможность перевести FunCube в режим программирования для перепрошивки FirmWare и обратно в рабочий режим.